北京电子科技学院计算机科学与技术系的前身是八十年代设立的第五教研室(计算机教研室)，1988 年9月成立计算机科学与技术系，93年开始第一届本科生招生，是我院最早招生本科生的系之一。
全系现有专兼职教职工33人，教授3人，副教授(含高级实验师)13人，与西电合作计算机体系结构和密码学硕士研究生导师5人，院学术学科带头人6人。具有博士学位的教师4人(含博士后2人)。
系设有计算机基础教研室、计算机硬件教研室、计算机软件教研室、计算机应用教研室和计算机硬件与应用实验室及信息技术实验室(原计算中心)和一个系设研究室。
该系不断地完善学科与专业建设，现设立"计算机科学与技术"和"信息安全"两个专业方向，课程体系设置坚持基础理论不动摇、能力培养为根本、突出创新能力培养、合理取舍教学内容，遵循高教规律的原则。"计算机科学与技术"专业方向的课程体系具有软硬件互相渗透和通信的行业特色;"信息安全"专业方向的课程体系以公共安全和实用密码理论与技术为对象。主要特色课程有：多媒体技术及加密、数据库原理设计及加密、数字图像处理及加密、嵌入式系统、Internet安全协议及应用、积极防御理论及应用、网络对抗技术、信息安全数学基础等。