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建校以来，我校培养了近3万名高素质的中医药人才，遍布安徽省及国内外医药领域。2000年以来，学校相继与皖北中药材支柱产业区、皖南新安医学发源地、皖西大别山革命老区等市县人民政府签订了全面科技合作协议，与河南宛西、江苏康缘、华润三九等国内知名中医药企业签订战略合作协议，建有亳州济人药业等 25个产学研合作基地，开展50多项技术服务。经过50多年的建设，学校已发展成一所以中医药学科为主，相关学科协调发展，办学层次齐全，中医药特色鲜明的高等中医药院校，为地方经济社会发展做出了积极贡献。
面向“十二五”，学校将深入贯彻落实科学发展观，秉承“至精至诚、惟是惟新”的校训理念和“北华佗·南新安”的医学传统，进一步坚定中医信念，弘扬中医精神，继续走“质量立校、人才兴校、科技强校、特色弘校、文化塑校、和谐融校”之路，解放思想，抢抓机遇，深化改革，加快建设，为创建富有特色、卓有贡献、高水平有影响的安徽中医药大学努力奋斗。
